Ekspozycja obejmuje część indyjską, poświęconą osobie patrona-słynnego misjonarza, oraz zbiory związane z prof. Piotrem Nawrotem – misjonarzem, odkrywcą i badaczem muzyki baroku misyjnego. W muzeum można zobaczyć między innymi makietę redukcji jezuickiej (osady misyjnej) z Ameryki Południowej, tradycyjne stroje, instrumenty muzyczne, przedmioty liturgiczne oraz rękodzieło.
Muzeum jest jednym z pięciu obiektów, w których można otrzymać odcisk pieczęci w specjalnym Paszporcie Podróżnika w ramach akcji Śladami podróżników dookoła Poznania.